A Santa Casa da Misericórdia de Pernes possui um vasto património imobiliário em Lisboa, fruto do legado do benemérito Comendador José Gonçalves Pereira, sendo constituído pelos prédios que, abaixo, se identificam:
- Rua Nova do Loureiro 8 a 16
- Rua de São Marçal, 85 a 89, tornejando Travessa de Monte Carmo, 13 a 19
- Rua Luís Fernandes, 14 a 22
- Rua de Santo António à Estrela, nº 132 a 136, tornejando Rua do Patrocínio, 2 a 4
- Travessa da Hera, nº3
- Travessa da Hera, nº5, tornejando Calçada do Combro 91 a 93
- Calçada do Desterro, 10B a 14
- Calçada do Lavra, nº20 a 20ª
- Calçada do Lavra, nº22
- Calçada do Lavra, nº24
- Rua Carvalho Araújo, 31
- Rua Saraiva de Carvalho, 224 a 230
- Rua Saraiva de Carvalho, 232 a 240, tornejando Rua Ferreira Borges, 2 a 10
- Rua Filipe da Mata, 106
- Rua Filipe da Mata, 172 a 178
- Estrela de Benfica, 480, A e B
- Rua da Bempostinha, nº 18 a 22
- Rua Actor João Rosa, 19 a 19A
- Calçada da Palma de Baixo, 13